Μια πρόσφατη μελέτη σχετικά με την εφαρμογή της μεταγονιδιωματικής αλληλούχισης επόμενης γενιάς (mNGS) διαπίστωσε ότι η mNGS μπορεί να επιτύχει έγκαιρη ανίχνευση παθογόνων και να επιταχύνει την ανάπτυξη στοχευμένων θεραπευτικών σχεδίων κατά των λοιμώξεων, βελτιώνοντας έτσι τα αποτελέσματα της θεραπείας και την πρόγνωση των ασθενών. Η έρευνα, που διεξήχθη από το Τμήμα Κλινικού Εργαστηρίου, το Δεύτερο Συνεργαζόμενο Νοσοκομείο του Πανεπιστημίου Nanchang και την BGI Genomics, δημοσιεύθηκε στο περιοδικό Frontiers in Cellular and Infection Microbiology.
Οι συμβατικές μικροβιολογικές εξετάσεις (CMTs) βασίζονται στην ανάπτυξη καλλιεργειών, τη μικροσκοπία και τις στοχευμένες δοκιμασίες PCR, προσφέροντας εξειδίκευση αλλά περιορισμένο πεδίο εφαρμογής. Ενώ οι CMTs παραμένουν οικονομικά αποδοτικές για κοινές λοιμώξεις, η mNGS παρέχει απαράμιλλο εύρος και ταχύτητα, επιτρέποντας τη διάγνωση σπάνιων/άτυπων παθογόνων (π.χ., Pneumocystis, ερπητοϊοί) εντός ημερών – κρίσιμη για την καθοδήγηση έγκαιρης και ακριβούς θεραπείας.
Τα αποτελέσματα της μελέτης αποκάλυψαν ότι η mNGS ανίχνευσε παθογόνα στο 86% των περιπτώσεων, ξεπερνώντας σημαντικά τις CMTs, οι οποίες αναγνώρισαν παθογόνα μόνο στο 67% των περιπτώσεων. Τα αποτελέσματα του φάσματος των ανιχνευμένων παθογόνων έδειξαν ότι το mNGS ταυτοποίησε 59 βακτήρια, 18 μύκητες, 14 ιούς και 4 ειδικά παθογόνα, ενώ τα CMT ανίχνευσαν μόνο 28. Αυτή η βελτιωμένη ικανότητα ανίχνευσης παρέχει στους κλινικούς γιατρούς ένα πιο ολοκληρωμένο διαγνωστικό εργαλείο για πνευμονικές λοιμώξεις.
Καθοδήγηση της ακριβούς ιατρικής
Η μελέτη έδειξε περαιτέρω ότι το mNGS καθοδηγεί τις αποφάσεις θεραπείας σε περιπτώσεις δύσκολα διαγνωστικών άτυπων παθογόνων, οδηγώντας σε καλύτερα αποτελέσματα για τους ασθενείς. Οι προσαρμογές της θεραπείας με βάση τα αποτελέσματα του mNGS βελτίωσαν την πρόγνωση για 16 ασθενείς που είχαν μολυνθεί με παθογόνα που συνήθως δεν εντοπίζονταν με τις συμβατικές εξετάσεις.
Το mNGS έχει αποδειχθεί πολύτιμο εργαλείο για την καθοδήγηση κλινικών αποφάσεων για τη θεραπεία λοιμώξεων. Στη μελέτη, οι γιατροί χρησιμοποίησαν τα αποτελέσματα του mNGS για να προσαρμόσουν τη θεραπεία με αντιβιοτικά για 133 ασθενείς, με το 40,6% των περιπτώσεων να επωφελούνται από πιο στοχευμένες θεραπείες. Αν και υπήρξε μία περίπτωση περιττής χρήσης αντιβιοτικών, τα συνολικά αποτελέσματα δείχνουν την αξιοπιστία του mNGS στη βελτιστοποίηση της φροντίδας των ασθενών.
Ανίχνευση άτυπων παθογόνων
Το mNGS υπερέχει στην ανίχνευση άτυπων παθογόνων, όπως το Mycobacterium tuberculosis, το Mycoplasma pneumoniae, το Chlamydia psittaci και μυκητιασικών λοιμώξεων όπως το Pneumocystis jirovecii και το Talaromyces marneffei. Αυτά τα παθογόνα, που συχνά παραβλέπονταν από τις παραδοσιακές μεθόδους, ταυτοποιήθηκαν με επιτυχία από το mNGS.
«Η μεταγονιδιωματική αλληλούχιση επόμενης γενιάς (mNGS) παρέχει μια ευρέος φάσματος, γρήγορη και ακριβή διαγνωστική προσέγγιση για την ανίχνευση παθογόνων σε πνευμονικές λοιμώξεις. Αυτό επιτρέπει την εξατομικευμένη αντιλοιμώδη θεραπεία και βελτιώνει τα αποτελέσματα των ασθενών», δήλωσε ο καθηγητής Wang Xiaozhong, διευθυντής του Τμήματος Κλινικού Εργαστηρίου, του Δεύτερου Συνεργαζόμενου Νοσοκομείου του Πανεπιστημίου Nanchang και αντίστοιχος συγγραφέας της μελέτης.
«Στο μέλλον, η ενσωμάτωση του mNGS με κλινικές εκδηλώσεις, ευρήματα απεικόνισης και παραδοσιακές μεθόδους δοκιμών για πολυδιάστατη ανάλυση θα βοηθήσει στη δημιουργία ενός ολοκληρωμένου διαγνωστικού και θεραπευτικού μοντέλου που θα περιλαμβάνει «ταχεία αναγνώριση – ακριβή παρέμβαση – δυναμική παρακολούθηση».» Ο Wang πιστεύει ότι αυτή η προσέγγιση θα παρέχει στους ασθενείς πιο επιστημονικές, αποτελεσματικές και εξατομικευμένες στρατηγικές θεραπείας.
Το mNGS απλοποιεί τη διαδικασία ανίχνευσης παθογόνων, προσφέροντας υψηλότερη ευαισθησία και ευρύτερες δυνατότητες ανίχνευσης σε σύγκριση με τις συμβατικές μεθόδους. Η ενσωμάτωσή του στην κλινική πρακτική παρέχει ακριβέστερες και έγκαιρες διαγνώσεις και επιτρέπει πιο στοχευμένες θεραπείες, βελτιώνοντας τελικά τα αποτελέσματα των ασθενών σε περιπτώσεις πνευμονικών λοιμώξεων.